Тему можно закрыть. Ответ дали в переписке с сотрудниками Dr.Web.
Для того, чтобы возобновить подписку в ЦУП, необходимо возобновлять ее в ручном режиме, т.к. ЦУП не определяет, была ли подписка приостановлена намеренно или случайно. Это необходимо отслеживать.