Juliya,
Судя по тому, что в первом логе уже на старте сервера умирал движок БД, скорее всего, там тоже уже имеет место битая БД. Только вот движок это не диагностирует.
Учитывая, что у Вас используется т.н. IntDB, то помимо восстановления есть смысл переехать хотя бы на SQLite3, она тоже не идеальна, но всё ж более живучая.