В общем, имеем тут следующее.
Энное количество станций, судя по всему – все или около того – регулярно отваливаются с connection reset (aka TCP RST). После отвала повторно логинятся, навскидку получится один коннект в среднем в 1-3 секунды. Как показывает практика, даже на SQLite3 (а у Вас сейчас аж SQLite2 ещё) это близко к потолку, причём может быть даже с верхней стороны. Для веб-интерфейса осложняется тем, что в 10 версии он на каждый запрос выполняет очень много транзакций, потому слишком часто вынужден ждать освобождения и без того перегруженной СУБД.
В общем, варианты следующие:
1) разобраться, почему агенты не живут подключенными дольше пары минут, чтоб они не устраивали DDoS
2) переехать на какую-либо более производительную СУБД, чтоб этот DDoS пережить, тут может быть хватит SQLite3, а может быть и нет
3) обновиться до 11, где интерфейс несмотря на все эти проблемы загружаться будет быстрее
Лучше сделать все три пункта (причём при выполнении 3 будет автоматом выполнен 2). По крайней мере без пункта 1 это всё равно работать не будет нормально, а пункт 3 полезен в принципе сам по себе.